Les ingénieurs de FRC utilisent le traitement biologique principalement pour éliminer les contaminants biodégradables des eaux usées. La méthode de traitement biologique du réacteur à biofilm à lit mobile (MBBR) de FRC utilise de petits morceaux de matériau porteur conçus pour maximiser la surface et favoriser la croissance de la biomasse. Le réservoir MBBR est rempli de ces supports, généralement à 30-70 % en volume. Le réservoir est aéré pour alimenter la biomasse et faire circuler les supports dans tout le réservoir, d'où la description de « lit mobile ». Les bactéries se développent sur les supports et consomment les contaminants, les convertissant en plus de biomasse qui peut ensuite quitter le réservoir et être séparée avec un système de flottation à air dissous (DAF) ou une autre forme de clarification.

FRC utilise la technologie MBBR pour éliminer la demande biologique en oxygène (DBO) des eaux usées, ainsi que pour éliminer l'azote et les composés à base d'azote, le phosphore et certaines formes de demande chimique en oxygène (DCO). Les systèmes MBBR sont applicables dans une grande variété d'applications industrielles et municipales.